Fense ea PDB ke eng?

Tsela ea ho bula, ho fetola le ho fetola lifaele tsa PDB

Faele e nang le boeletsi ba file ea PDB e ka 'na ea e-ba faele e entsoeng Lenaneong la Litlhaku tsa Lenaneo le sebelisetsoang ho boloka tlhahisoleseding ea ho phomola mabapi le lenaneo kapa modula, joaloka faele ea DLL kapa EXE . Ka linako tse ling li bitsoa lifaele tsa matšoao.

Mapoto a li-PDB mapaele a sa tšoaneng le lipolelo tsa mohloli oa mohloli ho sehlahisoa sa oona sa ho qetela, seo mobuseli a ka se sebelisang ho fumana fomoro ea mohloli le sebaka se sebetsanang le sona moo se lokelang ho emisa ts'ebetso ea ho itokolla.

Lifaele tse ling tsa PDB li ka 'na tsa e-ba ka mokhoa oa faele ea Protein Data Bank. Lifaele tsena tsa PDB ke lifaeletso tse hlakileng tse ngotsoeng li boloka likopano tse mabapi le liprotheine.

Lifaele tse ling tsa PDB li ka 'na tsa bōptjoa ka Palm Database kapa lipompiri tsa PalmDOC' me li sebelisoa le mokhoa oa ho sebetsa oa PalmOS. Lifaele tse ling ka mokhoa ona li sebelisa sebopeho sa .PRC sa file ho e-na le hoo.

Mokhoa oa ho bula File ea PDB

Mananeo a sa tšoaneng a sebelisa faele ea bona ea PDB ho boloka boitsebiso bo itseng ka mokhoa o itseng oa boitsebiso bo hlophisitsoeng, ka hona kopo e 'ngoe le e' ngoe e sebelisetsoa ho bula mofuta oa mofuta oa PDB. Geneious, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio, le Pegasus ke mehlala e seng mekae ea mananeo a ka sebelisang fomati ea PDB e le faele ea database. Radare le PDBparse ba ka sebetsa ho bula lifaele tsa PDB hape.

Lifaele tse ling tsa PDB li bolokiloe e le lintlha tse hlakileng, joaloka Geneious 'Program Debug Database lifaele,' me li ka baloa ka hohle-hohle ha li ka buloa ka mohlophisi oa mongolo. O ka bula mofuta ona oa faele ea PDB le lenaneo le ka balang litokomane tse ngotsoeng, joalo ka lenaneo le kenyelletsoeng ho Notepad ho Windows. Li-PDB tse ling tsa lifilimi le bahlophisi ba kenyeletsa Notepad ++ le Brackets.

Litokomane tse ling tsa database tsa PDB ha li na litokomane tsa mongolo ebile li na le thuso feela ha li buloa le lenaneo leo li reretsoeng lona. Ka mohlala, haeba faele ea hau ea PDB e amana ka tsela e itseng ea Potlakase, leka ho sebelisa software hore u shebe kapa u fetole file ea PDB. Visual Studio e lebeletse ho bona faele ea PDB ka fenseteng e tšoanang le faele ea DLL kapa EXE.

U ka sheba le ho fetola lifaele tsa PDB tse fanoeng ke Protein Data Bank, ho Windows, Linux, le macOS le Avogadro. Jmol, RasMol, QuickPDB le USCF Chimera e ka bula file ea PDB hape. Kaha lifaele tsena li ngotsoe ka mokhoa o hlakileng, o ka bula fono ea PDB hape le mohlophisi oa mongolo.

Palm Desktop ea Palm e lokela ho tseba ho bula lifaele tsa PDB tse Palm File file file empa u ka 'na ua tlameha ho e bitsa lebitso la pele hore u be le lengolo la .PRC la faele bakeng sa lenaneo leo ho le hlokomela. Ho bula file ea PalmDOC PDB, leka STDU Viewer.

Tsela ea ho fetola File ea PDB

Lenaneo la Litlaleho tsa Lenaneo le ka 'na la se ke la fetoloa ho fomati e fapaneng ea faele, bonyane eseng ka sesebelisoa se tloaelehileng sa convert . Ho e-na le hoo, haeba ho na le sesebelisoa leha e le sefe se ka fetolelang mofuta ona oa faele ea PDB, e tla ba lenaneo le le leng le ka le bulelang.

Ka mohlala, haeba u hloka ho fetola fensetere ea database ea PDB ho tloha Quicken, leka ho sebelisa lenaneo leo ho le etsa. Mofuta ona oa phetoho, leha ho le joalo, mohlomong ha o sebelisoe feela empa o boetse o sa tšehetsanoe ho mekhoa ena ea li-database (ke hore mohlomong ha ho hlokahale hore u fetole mofuta ona oa faele ea PDB ho mofuta ofe kapa ofe).

Protein Data Bank lifaele tsa rona li ka fetoloa ho tse ling tsa li-MeshLab. Ho etsa sena, u ka tlameha ho qala ho fetolela fomoro ea PDB ho WRL le PyMOL ho Files> Save Image As> VRML menu, ebe o kenya file ea WRL ho MeshLab ebe o sebelisa File> Export Mesh As menu ho qetela ho fetola PDB faele ho STL kapa mofuta o mong oa faele.

Haeba u sa hloke mohlala hore o be le 'mala, u ka romela file ea PDB ka kotloloho ho STL le USCF Chimera (link ea download e ka holimo). Ho seng joalo, o ka sebelisa mokhoa o tšoanang le o ka holimo (ka MeshLab) ho fetola PDB ho WRL le USCF Chimera ebe joale u romela file ea WRL ho STL ka MeshLab.

Ho fetola PDB ho PDF kapa EPUB , haeba u na le file ea PalmDOC, ho ka khoneha ka mekhoa e fapaneng empa mokhoa o bonolo ka ho fetisisa ke oa ho sebelisa converter PDB ea marang-rang joaloka Zamzar . O ka kenya faele ea hau ea PDB ho websaeteng eo ho ba le monyetla oa ho e fetisetsa ho lihlopha tsena hammoho le AZW3, FB2, MOBI , PML, PRC, TXT, le liforomo tse ling tsa li-file tsa eBook.

Ho fetola faele ea PDB ho fomati ea FASTA ho ka etsoa ka PDB ea Moiler Lab ho FASTA.

Hape hoa khoneha ho fetola PDB ho CIF (Crystallographic Information format) ho sebelisa Inthaneteng ho sebelisa PDBx / mmCIF.

Ho Bala ka ho Fetisisa ho Files ea PDB

U ka bala ho hongata ho mabapi le Lenane la Database Database ho tsoa ho Microsoft, GitHub, le Wintellect.

Ho na le ho hongata ho ithuta ka li-file tsa Protein Data Bank hape; sheba Worldwide Protein Data Bank le RCSB PDB.

Na File ea Hao e sa Ntse e sa Bulehe?

Lifaele tsa PDB tse sa bulehang ka lithulusi tse tsoang holimo, mohlomong ha e le hantle lifaele tsa PDB. Seo e ka 'nang eaba se etsahala ke hore u sebelisa hampe phaseji ea faele; mefuta e meng ea lifilimi e sebelisa sekoti se tšoana haholo le ".PDB" ha li hlile li sa tsamaisane ebile ha li sebetse hantle.

Ka mohlala, faele ea PDF ke faele ea tokomane empa boholo ba mananeo a tsoang ka holimo a ke ke a fana ka litemana le / kapa litšoantšo ka tsela e nepahetseng haeba u leka ho bula lenaneo lena la mananeo. Ho joalo le bakeng sa lifaele tse ling tse nang le li-file extension, tse kang PD, PDE, PDC le PDO.

PBD ke e 'ngoe ea lenaneo la EaseUS Todo Backup mme ka hona e le molemo feela ha e buloa ka software eo.

Haeba u se na faele ea PDB, joale u etse lipatlisiso ka boeletsi ba lifaele tseo file ea hau e nang le tsona e le hore u ka fumana lenaneo le loketseng le le bulang kapa le le fetolang.